Le château actuel a été reconstruit au début du 17ème siècle sur l'emplacement de l'ancien château fort pillé et détruit pendant les guerres de religion (1562 - 1572). Aux 16ème et 17ème siècles, il était possédé par la famille BOYER, originaire de Cluny et qui prit le nom de Chanlecy. Le nom de Chanlecy aurait été abandonné à la vente des Chanlecy, et la seigneurie aurait pris le nom de la paroisse de CHAMPLECY,certainement parce qu'il n'y avait pas continuité héréditaire. Les vendeurs avaient vendu les biens, mais non leur nom de famille. Source : http://madamedartagnan.free.fr/champlecy/chateau.htm
Au début du XVIIe siècle, Jean-François bâtit le château non loin d'une ancienne motte. En 1645, son fils, également nommé Jean-François de Champlecy, hérite de la seigneurie. Au milieu du XVIIe siècle, sa nièce, Charlotte de Champlecy, baronne de Sainte-Croix, lui succède ; elle épouse Jean-Éléonor de Damas et, en secondes noces, Charles de Batz de Castelmore d'Artagnan, modèle du héros d'Alexandre Dumas.